พิพิธภัณฑ์ตำหนักปลายเนิน หรือวังคลองเตย เป็นตำหนักเรือนไทยที่ประทับของสมเด็จฯ เจ้าฟ้ากรมพระยานริศรานุวัดติวงศ์ ตั้งแต่พระชันษา 51 ปี ซึ่งเป็นสถานที่สำคัญแห่งหนึ่งที่ทรงใช้สร้างสรรค์งานออกแบบและงานศิลปะหลายแขนงจนได้รับการยกย่องว่าเป็นสมเด็จครูของช่างและศิลปิน ภายในพิพิธภัณฑ์แบ่งพื้นที่ตำหนักจัดแสดง โดยใช้ตู้หนังสือสูงกั้น ด้านหน้าตู้แขวนภาพพระพุทธรูปลีลาทั้ง 2 ข้างแขวนภาพพระสาวกและภาพเทวดาเหาะมาเฝ้า ซึ่งต่อมาได้เป็นภาพต้นแบบสำหรับเขียนผนังพระอุโบสถวัดราชาธิวาส โดยนายชี ริโกลี เป็นผู้เขียนขยายขึ้น