เนื่องในโอกาสที่พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดช ทรงมีพระชนมายุครบ 72 พระชันษา ในปี พ.ศ. 2542 กรมประมงโดยศูนย์ศึกษาการพัฒนาประมงอ่าวคุ้งกระเบน และสำนักงานคณะกรรมการพิเศษเพื่อประสานงานโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริ (กปร.) ร่วมเฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว โดยดำเนินการก่อสร้างสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำในบริเวณพื้นที่โครงการศูนย์ศึกษาการพัฒนาอ่าวคุ้งกระเบน อันเนื่องมาจากพระราชดำริ

การก่อสร้างสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำ ดังกล่าว ความทราบถึงฝ่าละอองธุลีพระบาท พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวทรงพระราชทานนามสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำแห่งนี้ เพื่อเป็นศิริมงคลว่า  "สถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำเฉลิมพระเกียรติ 6 รอบ พระชนมพรรษา"

 สถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำแห่งนี้ได้เปิดบริการประชาชนทั่วไป ตั้งแต่วันที่ 13 เมษายน พ.ศ.2544 ต่อมาสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ได้เสด็จพระราชดำเนินทรงเปิดอาคารสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำแห่งนี้อย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ 5 กรกฏาคม พ.ศ.2545

การจัดแสดงนิทรรศการถาวร 

1. สถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำเค็ม นิทรรศการแบ่ง ตามประเภทของสัตว์น้ำ อาทิ

ปลาเศรษฐกิจ ปลาสวยงาม ปลาในแนวปะการัง ปลาที่มีรูปร่างแปลก 

2. เครื่องมือประมงของไทย อธิบายเครื่องมือจับสัตว์น้ำของไทย ทั้งน้ำจืดและน้ำเค็ม และข้อแนะนำเกี่ยวกับกฎหมายที่เกี่ยวข้องกับการทำประมงชายฝั่ง

3. ระบบนิเวศชายฝั่ง อธิบายถึงระบบนิเวศชายฝั่ง ทั้งระบบนิเวศแนวปะการัง ระบบนิเวศหาดหิน และระบบนิเวศหาดทราย โดยมีทั้งการใช้สื่อป้ายนิเทศก์ และมีการทำตู้จัดแสดงจำลอง

4.จุลนิทรรศการสังขวิทยา จัดแสดงเปลือกหอยทะเลทั้งหอยฝาเดียวและหอยสองฝา